CoverageTool:一款用于植物表型分析的半自动化图形处理软件

本文提出了一种能够详细描述视觉植物性状的新型半自动化且性能稳定的测量工具——CoverageTool,植物表型资讯介绍如下:

植物性状的视觉表征和量化往往受限于处理特定环境而开发的工具以及软件。本文提出了一种能够详细描述视觉植物性状的新型半自动化且性能稳定的测量工具——CoverageTool

CoverageTool:一款用于植物表型分析的半自动化图形处理软件

使用MSPaint中的“裁剪”功能进行分析的图像准备示例

CoverageTool是一款灵活的多功能软件,能够以cm2为单位进行面积计算,也可以以百分比为单位进行覆盖面积计算,适用范围广泛。研究人员演示并讨论了CoverageTool在植物表型广谱量化中的应用,例如:组织培养参数、一年生植物冠层地表覆盖度、根和叶的投影表面积以及叶片衰老面积比。CoverageTool软件易于操作,虽然在使用过程中存在操作员颜色选择时的主观性,但是将它们均匀地分布于完整的样本集,使其对研究对象进行定量比较成为可能。

CoverageTool:一款用于植物表型分析的半自动化图形处理软件

小麦叶片投影表面积计算

CoverageTool:一款用于植物表型分析的半自动化图形处理软件

容差水平调整

综上所述,CoverageTool适用于量化多种生物、环境对视觉植物性状的影响。另外,在最近发表的几项研究中,CoverageTool在量化不同植物表型方面表现突出,可能应用于其他领域的研究。

CoverageTool:一款用于植物表型分析的半自动化图形处理软件

组织培养颜色分析:烟草(Nicotiana tabacum)SR1和SNN再生的愈伤组织

来源:

M-O L, Ovnat Z, Amir-Segev O, at al. CoverageTool: A semi?automated graphic software: applications for plant phenotyping. Plant Methods. https://doi.org/10.1186/s13007-019-0472-2

来源:毛巾听话

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