Linux软件安装 Amber20

假设你已经有了Amber20的源代码,文件夹名叫amber20_src,并且现在在amber20_src这个目录里面。

安装串行版本的Amber

进入build文件夹内,执行run_cmake脚本,然后make install:

之后,Amber20便已安装在../amber20内,执行以下命令激活它:

安装并行版本的Amber

安装并行版本前,请先安装串行版本。

先下载并安装mpich,执行AmberTools/sec/configure_mpich g后mpich将自动安装:

安装好mpich后,我们修改build文件夹下的run_cmake文件,将-DMPI=FALSE改为-DMPI=TRUE。用diff表示就是:

之后重复串行的安装操作,执行run_cmake,并make install,即可:

并行版本的Amber同样安装在../amber20文件夹内。

参考文献:

Amber 2020 Reference Manual,http://ambermd.org/doc12/Amber20.pdf

来源:曾晋哲

声明:本站部分文章及图片转载于互联网,内容版权归原作者所有,如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢!

上一篇 2020年7月19日
下一篇 2020年7月19日

相关推荐