最近，有很多医生小伙伴反应：绘制细胞通路图，太让人发愁了！
现在的医生，不仅要上得了手术台，还要搞的定科研，好不容易得到了实验结果还要用专业的方式秀出来。人靠衣装，佛靠金装，科研成果靠技术装。
信号通路作为细胞内活动的真实写照，素来都是分子机制研究的重头戏，因而无论是基金申请还是高分文章，都少不了要抱抱信号通路的大腿。
人家文章的信号通路好美，而你的好low？
高质量的信号通路图有啥作用？
打印成海报，挂在实验室或者宿舍，熟悉上下游的同时，没准哪天悟出来一个牛逼轰轰的idea；
放到SCI论文里面，把你的研究成果形象地展示出来；
放到基金申请书里面，清楚明白地展示你的科研假说在哪里；
放到PPT里，再也不用担心你蹩脚的英语讲不清；
放到课题/项目答辩里面，瞬间提高一个档次；
……
一图胜千言，有图有真相，四两拨千斤，懂得都懂！
信号通路图到底是啥？
信号通路由三部分原件构成
原件1：受体（receptor）和配体（ligand）
受体（Receptor）：指一类能传导细胞外信号，并在细胞内产生特定效应的分子。包括膜受体和胞内受体。
配体（ligand）：指一种能与受体结合以产生某种生理效果的物质，也被成为信号传导过程中的第一信使。
细胞外能与受体结合的分子一般称之为配体，包括激素生长因子，细胞因子，神经递质，还有其他各种各样的小分子化合物；
原件2：蛋白激酶（kinase）
蛋白激酶（kinase）是一类磷酸转移酶，作用是把 ATP 的磷酸基转移到它底物的某个蛋白的特定的氨基酸残基上面去，从而就改变了这个下游蛋白的构象。
但蛋白激酶是经由第二信使活化后方可产生作用。第二信使是配体和受体结合之后激活的胞内的信号分子小分子物质，有助于信号向胞内进行传递，比如环磷腺苷 cAMP，环磷鸟苷 cGMP，以及钙离子等等。
常见的蛋白激酶有：酪氨酸激酶 (PTK) 和丝氨酸 / 苏氨酸激酶 (STK)
原件3：转录因子（transcription factors）
对基因转录有调节作用的蛋白，那么细胞对信号转导有诸多反应，最终都是涉及到蛋白和 DNA 相互识别和相互作用，引起一些基因表达的改变，所以也有人把信号通路当中的转录因子统称为第三信使。
信号传导过程：那么当配体特异性的去结合到细胞膜也或者是细胞内的受体，配体和受体结合之后细胞内的一系列蛋白就会依次对下游蛋白的活性进行调节，包括是激活或者是抑制的作用，从而将外界的信号进行逐步的放大，传递，最终产生一系列综合性的细胞应答上游蛋白对下游蛋白的调节主要是通过添加或者去除磷酸基团，从而改变下游蛋白的这个空间构象来完成的。
三步教你成为信号通路达人
第一步
记住几个大小BOSS
大Boss是谁？是不是总是听到一些很牛逼的分子，比如p53、mTOR、Hippo······大Boss们都是处于信号中心，动一发牵全身，所以信号通路常常会以它们命名。还有些大Boss会强强联手组成一个信号通路的核心，比如TGF-β/Smad、Jak/Stat、PI3K/Akt、MAPK/ERK等。
有些小Boss也是要记的，因为人家同样功能强大，以它们为主角的相关文献堆积成山，是传说中的明星分子，比如：BCL-2、BAX、PTEN、CDK4、caspase系列、KRAS、FOXO1等（不胜枚举）。其余小喽啰们（大Boss遥远的上下游蛋白），如果不是你研究的对象或者研究对象直接上下游，不要太care，除了蛇精病没人让你背出来！
第二步
向大小BOSS上下游延展
所谓研究机制，入门级的无非是A-B-C三个分子之间（A调控B，C是B的底物）的相互关系，例如A在X细胞中的作用是依赖B和C的，敲除A后BC表达发生改变，用BC的抑制剂或者激活剂可以改变A敲除的效果等等。我建议你首先要选定自己研究的某个BOSS或者小喽啰，然后以它们为中心，向上下游“开火”。
比如人家让你研究A，这里以抑癌基因FOXO1在肝癌细胞凋亡过程中的机制为例，要知道FOXO1正好处于PI3K/Akt和MAPK/ERK两条信号转导通路的汇聚点：
这时候关键的是确定B和C，做了相关芯片的可以去找表达差异基因是否处在这两个通路中，穷X的实验室可能就得手动大批量qRT-PCR了。
第三步
启动高能豪华装备
光说不练是绝对不行滴，我给大家送福利来助攻各位上手，顺利展现信号通络绝活！
1. 基础数据库推荐
想要自己对感兴趣的信号通路进行查询，有时间不妨访问下面几个比较赞的国外数据库：
KEGG：www.genome.ad.jp/kegg/（点此教你KEGG入门）
Nature：pathwayinteraction database
Science：STKE——database of pathway
2、通路图绘制常用软件推荐
想做出超高颜值SCI通路图，必然少不了以下几大作图软件：
IBS
该软件是由华中科技大学薛宇教授的CUCKOO团队做的，非常适合绘制基因结构、序列互作结合的示意图。IBS可以下载使用也可以在线使用，两者唯一的差别就是下载版的样品图比在线版要多。
ScienceSlide
ScienceSlide是一款专门做医学图片的ppt插件，安装后，会在PPT界面出现一个工作条，包括了常用元件、信号通路、方法学、生物化学、分子生物学等几千种素材。
只需要选择相应的模板就可以在此基础上，进行文字及分子形状的修改而后做成精致无比、赏心悦目的示意图。
PathwayBuilder
这是一款专业的细胞信号通路绘图软件，功能强大，体积容量比较小，使用方便。
软件自带基本元素（分子、细胞、模式生物、甚至人体组织器官及系统的）模板，还自带很多经典通路，在上面可以直接修改，非常方便。
3、顶级装备推荐——《医学信号通路图解》
除了数据库和作图软件加持，这本《医学信号通路图解》才是你必须要看的！！！
它能帮你理清思路，打好根基。解螺旋刚开启了0元免费领书活动，现在，这本书可以0元包邮送到家！！！哪里不会翻哪里，一本看完，从此面对复杂的通路机制不再迷茫！
这本书有多牛呢？
目录如下图：
亮点1：大牛力荐，科研小白入门必读
南方医科大学珠江医院肿瘤科主任张健教授为本书做序，初衷是帮科研小白走进科研大门，解决阅读文献后，不能清晰把握该文献的主题思路；不能清楚理解各种细胞信号通路的研究途径；关于机制方面的研究更是没头绪等”三不能“问题。
本书的“图说”的过程，是几位研究生反复对文献进行阅读与理解的过程，也是科研小白逐步成长的过程，可高效提升大家的科研思维和能力。
亮点2：高分杂志精华图，让你深刻认识疾病及机制
一篇的文章的精华都在于图片的展示，一张美观的通路机制图可以帮助我们形象直观地理解复杂的通路机制网络。
《医学信号通路图解》中的图片来自高分杂志中的精华部分，对各个常见病种、常见机制的深入分析及总结归纳，将通路机制涉及相关的知识点进行拓展和归纳总结，有助于大家对疾病及机制有全面的认识。
亮点3：图片解读思路新颖，助力你发SCI、中标国自然
文中对图片进行解读，内容涉及干细胞的起源及克隆进化、肿瘤浸润淋巴细胞、肿瘤代谢通路、免疫代谢、铁死亡、蛋白互作网络等科研热点问题。
能帮助大家直观了解相关热点问题的研究方法和思路，帮助读者理解与记忆，从而较好运用到自己的科研实践之中。
这是一本可供大牛阅读学习的书，更是为医学小白扫盲信号通路图的书，一本扫清你发SCI路上的障碍，高颜值通路图，助力你脱单卷死室友，秒杀医学同行！
适合人群：
任何刚步入生物领域科研的人
文献阅读困难症患者
国自然基金申请者
课题设计中机制部分遇到问题的医学生
本书不出售，可扫描对应海报二维码
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来源：解螺旋
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