【生物信息学】蛋白质结构预测与可视化方法，VMD的使用入门教程

今天是2022年2月22日，正月二十二星期二，在这百年最有“爱”的日子，继续前一问题的探讨。
场景1：
A同学想要从对蛋白结构影响的角度说明 自己发现 的 患者（病人）携带的DNAH1 突变（如 p.Val131Ala）对蛋白结构的影响，通过SWISS-Model自己构建了 正常情况下的蛋白结构，又同时构建了突变情况下的蛋白结构，如何对它们进行展示 以用于文章中的图呢/p>

2.打开一个蛋白质结构
主窗口中点 File-New Molecule-弹出新窗口-Molecule File Browser（文件读取窗口）-文件读取窗口中点 Browse-自动打开 VMD-安装目录-进入 proteins 文件夹-选择 VMD 自带的演示结构 bpti.pdb-文件读取窗口中点 Load-显示窗口出现蛋白质结构
（注意：当有了自己的蛋白结构后，我们可以基于练习运用到实践中）

4.恢复结构初始位置：
主窗口中点 Display – Reset View。或者在显示窗口内单击鼠标左键以激活窗口后，点击“=”键。
（适合一顿操作猛如虎后的补救）

5.进阶操作

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参考文章：
1.https://www.biomart.cn/experiment/430/586/588/2714611.htm
2.山东大学《生物信息学》教程

来源：爱做饭的电饭煲