2021年9月16日，中国科学院上海巴斯德研究所崔杰研究组在国际学术期刊《科学通报》（Science Bulletin）以Short Communication的形式在线发表了题为“Comparative study of the malacostraca viromes between deep sea andshallow water”的最新研究成果。
图片摘要：研究团队揭示了深海柯氏潜铠虾携带的10类病毒（Nidovirales、Nudiviridae、Bunyavirales、Hepelivirales、Ghabrivirales、Jingchuvirales、Wolframvirales、Picornavirales、Qinviridae和Articulavirales）。基于深海-浅海间的病毒组比较，他们展现了不同深度海洋生物的病毒组结构的差异以及相似性：在深海柯氏潜铠虾携带的10类病毒中，Articulavirales和Qinviridae的病毒只在深海软甲纲动物中分布，而其余8类病毒同时被深海和浅海的软甲纲动物携带。此外，研究团队还对病毒和宿主的相互作用进行了描述，例如Hepelivirales的病毒在软甲纲动物中表现出了一定的宿主限制性。整体而言，这项研究首次报道了深海虾类的病毒组组成，并对深海-浅海生物的病毒组进行了比较分析，有助于扩展人们对海洋病毒遗传多样性、进化、生态学特征的认识。
研究团队揭示了深海柯氏潜铠虾携带的10类病毒（Nidovirales、Nudiviridae、Bunyavirales、Hepelivirales、Ghabrivirales、Jingchuvirales、Wolframvirales、Picornavirales、Qinviridae和Articulavirales）。基于深海-浅海间的病毒组比较，他们展现了不同深度海洋生物的病毒组结构的差异以及相似性：在深海柯氏潜铠虾携带的10类病毒中，Articulavirales和Qinviridae的病毒只在深海软甲纲动物中分布，而其余8类病毒同时被深海和浅海的软甲纲动物携带。此外，研究团队还对病毒和宿主的相互作用进行了描述，例如Hepelivirales的病毒在软甲纲动物中表现出了一定的宿主限制性。整体而言，这项研究首次报道了深海虾类的病毒组组成，并对深海-浅海生物的病毒组进行了比较分析，有助于扩展人们对海洋病毒遗传多样性、进化、生态学特征的认识。
深海和浅海软甲纲病毒组：a.采集的潜铠虾图。b.深海和浅海软甲纲生物样本中发现的病毒种类和数目。深蓝色代表深海，浅蓝色代表浅海。圆中数字代表每类样本中的病毒种类数，括号中数字代表该目或科病毒的条数。c.软甲纲生物宏转录组数据中的病毒种类和分布。上方柱状图为每个测序文库中的reads或非rRNA reads数，条形图上方是文库的名称和宿主类型。下方柱状图和折线图展示了每个文库中的病毒种类和丰度，不同颜色代表不同目或科的病毒种类。d.热图展示了不同深度软甲纲宿主和病毒分类之间关系。
硕士研究生张誉译和廖蒙恩为本文的共同第一作者，崔杰研究员为本文的通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、中国科学院分子病毒与免疫重点实验室等项目的资助。崔杰团队长期从事病毒演化研究，近年来聚焦于海洋病毒组技术开发与应用，揭示海洋病毒的遗传多样性、进化规律、传播模式和海洋病毒参与元素循环特征，已发表多篇开拓性的工作。
文章链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2095927321006253
来源：刘永鑫Adam
声明：本站部分文章及图片转载于互联网，内容版权归原作者所有，如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢！