非模式生物KEGG富集分析: clusterProfiler

2021年7月1日下午12:41 • 软件开发

用到的软件：clusterProfiler（感谢Y叔）
对于非模式生，可以先做KEGG注释，用注释文件直接进行计算，GO富集同理。
用到三个文件
1.背景基因的注释信息(所有可以注释到的基因)，两列
2.ko的描述信息文件，两列
3.差异基因文件（软件会自动删掉没有注释到的基因），一列

来源：Gossie

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