利用MEGA做序列比对

MEGA是Molecular Evolutionary Genetics Analysis的英文简称,MEGA是一款功能强大、操作简单,图形化界面的应用于分子进化遗传学分析的软件。

1993年,MEGA首次发布,2021年7月,马上到而立之年的MEGA发布了第11版,也是目前(2022年1月)的最新版本。

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利用MEGA做序列比对

将存放着序列信息的fasta格式文件拖拽到MEGA程序中,选择align。

利用MEGA做序列比对

没问题,点击上方菜单栏Alignment下的Align by ClustalW/MUSCLE或者点击下方的W /均可。

利用MEGA做序列比对

比对好了,再返回DNA Sequences窗口,大致浏览一下,符合预期。

选择左上角的Data菜单栏,选择Save Session,保存为用于后续分析的.mas格式,也可以选择Export Alignment,再选择FASTA Format,将原始杂乱的序列保存为比对好的序列。

来源:name_qgy

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