使用pheatmap软件绘制基因表达热图
Drawing heatmap about gene expression patterns through pheatmap package
写在前面 在基因的表达模式分析中,我们往往需要对量化的多个基因表达数据进行可视化处理,使得我们所关注的基因在物种的不同组织以及同一组织的不同处理下的表达情况一目了然。在日常研究中,我们往往习惯于选择热图实现这一基因表达模式可视化的需求,进而直观的表述我们的基因表达模式的分析结果。
基因表达热图 所谓基因表达热图就是通过不同的颜色反应同一基因在不同样本中的一个表达情况,具体如下图所示:
pheatmap.pdf致谢:特别感谢CJchen在其博客http://www.cjchen.name/=328中对pheatmap的详细介绍,本文
是在借鉴(抄袭)其博文的基础上,根据我的数据分析经验进行的汇总。
转载本文请联系原作者获取授权,同时请注明本文来自陈振玺科学网博客。
链接地址:http://blog.sciencenet.cn/blog-1334016-932200.html
上一篇:通过基因ID文件从fasta文件中提取特定的基因
下一篇:Unix文件处理——获得比对到目标数据库中的序列数目
相关资源:陈式太极拳教学软件+注册机1-专业指导文档类资源-CSDN文库
来源:皆苦52
声明:本站部分文章及图片转载于互联网,内容版权归原作者所有,如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢!