有机晶体数据库_福利干货：晶体学数据库大盘点

在信息化社会，充分有效地管理和利用各类信息资源，是进行科学研究和决策管理的前提条件。数据库技术是管理信息系统、办公自动化系统、决策支持系统等各类信息系统的核心部分，它也是进行科学研究和决策管理的重要技术手段。

因此，为了深入地对晶体学进行研究和探索，几个著名的晶体学数据中心相继被建立。这些数据中心的主要作用之一是收集、储存和提供已知化合物的晶体结构数据。因此，越来越多的科学杂志在发表论文前，把论文有关的晶体学参数、化合物分子式、晶胞参数、空间群、原子坐标及其原子位移参数、精修结果参数等，以电子版的形式存放到这些著名的国际晶体学数据中心。

So，本期的干货就是：对晶体学数据库来个大盘点吧！

五大晶体学数据库

1. 剑桥结构数据库(The Cambridge structural Database, CSD )(英国)

位于英国剑桥大学的剑桥晶体数据中心(Cambridge Crystallographic Data Centre, CCDC)自1965年起就从事晶体数据的收集、整理与计算机化的工作。

CCDC提供的剑桥晶体结构数据系统(Cambridge Structural Database System, CSDS)是该中心同美国Brookhaven国家实验室合作的成果，基本上包括已发表的所有原子个数(包括氢原子)在500以内的有机及金属有机化合物晶体数据，并对收集的数据进行严格评审。

CCDC目前提供的CSDS 包括剑桥结构数据库(Cambridge Structural Database, CSD)是基于X射线和中子衍射试验唯一的有机小分子及有机金属分子晶体结构数据库。它只收集并提供具有C-H键的所有晶体结构，包括有机化合物、金属有机化合物、配位化合物的晶体结构数据。

图2 PDB

3. 无机晶体结构数据库(The Inorganic Crystal Structure Database, ICSD)(德国)

ISCD收集并提供到目前为止所有试验测定的、除了金属和合金以外、不含C–H键的无机物晶体结构的信息，包括化学名和化学式、矿物名和相名称、晶胞参数、空间群、原子坐标、热参数、位置占位度、R因子及有关文献等各种信息。

该数据库从1913年开始出版，至今已包含近10万条化合物目录。每年更新两次，每次更新会增加2000种新化合物，所有的数据都是由专家记录并且经过几次的修正，是国际最权威的无机晶体结构数据库。它和剑桥结构数据库(CSD)是国际上重要的两大晶体学数据库。

Imp：ICSD也推出了自己的检索工具，名为FindIt，是商业化的软件，如果你愿意的话可以购买这个软件或者登录(http://icsd.fiz-karlsruhe.de)去索要晶体结构信息，有时它甚至比CCDC更加常用。

图4 CRYSTMET

5. JCPDS－国际衍射数据中心的粉晶数据库(JCPDS-International Center for Diffraction Data, JCPDS-ICDD)(美国)

国际衍射数据中心The International Centre for Diffraction Data)(ICDD是一个非盈利的科学组织，致力于收集、编辑、出版和发行用于晶态材料鉴定的粉末衍射数据。粉末衍射文件中包含了760019多个唯一的材料数据条目。在该库中，每一种单相物质都有一套资料，包括晶体名称、化学成分、参考文献、收集衍射数据时的实验条件、各条粉晶衍射的 d-I/I1 值等。这些资料除了在卡片上可提供检索外，还记录在磁带和磁盘上，便于用电子计算机进行自动检索。

图6 COD

7. 矿物拉曼光谱、x射线衍射和化学数据的综合数据库(the RRUFF Project website containing an integrated database of Raman spectra, X-ray diffraction and chemistry data for minerals, RRUFF)

RRUFF项目是创建一套完整的矿物质高质量光谱数据，并且和世界分享这些正在开发的技术信息。RRUFF可以查询各种矿物的晶体学数据。

图8 CSLS

9. 有机化合物数据库(the Organic Compounds Database, OCD)

OCD中包括2483种有机化合物数据。

图10 BCS

11. 物理学参考数据(Physical Reference Data, PRD)

PRD中包括元素数据索引、元素的原子属性、物理常数、原子光谱数据、分子光谱数据、原子和分子数据、X射线和伽马射线数据、辐射剂量测定数据、核物理数据和凝聚态物理数据等。

图12 原子散射因子数据库

13. 元素X射线特征表

通过单击元素名称的任何按钮，来获得其X射线的属性。

图14 PTW

15. 化学元素物性周期表

图16 MCSD

17. 美国矿物学家晶体数据库(American Mineralogist Crystal Structure Database, AMCSD)

这个网站是一个包括发表在美国矿物学家，加拿大矿物学家，欧洲矿物学和物理化学矿物学报，以及从其他期刊中选取数据集的晶体结构数据库的接口。该数据库是由美国矿物学会和加拿大矿物学协会监管，以及由美国国家科学基金会资助。数据库提供交互式软件套件，可以用于查看和设置晶体结构和计算晶体的不同性质，例如几何形状，衍射图案，和晶体电子密度。

图18 DZS

19. 矿物结构数据库( Mineral Structures Database, MSD)

MSDB包含大多数岩石形成矿物的晶体和其物理性质的数据。

图20 MD

21. 矿物学数据库(Mindat.org)

分享一切对矿物有关的知识。

图22 AM

23. 印地安那大学分子结构中心分子结构数据库(Molecular Structure Center, MSC)

图24 晶体之星

欢迎大家来补充。

来源：材料人

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来源：懒饭