文献管理软件 JabRef 快速入门

我曾经非常愚蠢地认为手工维护自己的参考文献库就可以了，但随着看过论文的增加，文献的管理成为一件痛苦的差事。最近才领略到使用文献管理软件的方便。 JabRef 的中文教程比较少而不全，所以就写了这篇博客，简要介绍一下这个软件的使用方法。

聪明如你，肯定知道该怎么做吧。点开 citation 的链接，将内容保存为相应的文件名。比如 BibTeX 格式的 citation 信息，将其保存到名为 xxx.bib 的纯文本文件中，然后到 JabRef 里选择 File->Import into current database，将该文件导入当前数据库，你就会发现数据库中多了一条记录。当然，JabRef 支持很多 citation 信息格式，但是既然 JabRef 采用 BibTeX 格式管理数据库，我们还是尽量下载 BibTeX 格式的 citation。

每次只导入一条记录未免太麻烦了些，由于很多参考文献信息都是纯文本格式的，那么我们可以将很多条记录分段拷贝到 xxx.bib(或者 xxx.ris 等) 里，然后集中导入。

如果你已经下载到了论文的 pdf 文件，知道论文的标题名和数据库名，那么你就不用再去网站下载 citation 信息，可以直接在 JabRef 中用标题名搜索该论文。比如你知道论文标题叫做 A Survey of xxxxxxx，可以从 IEEEXplore 数据库中获得，那么你可以直接在 JabRef 中选择 Web search->Search IEEEXplore，然后用标题名搜索，点 Fetch，就可以直接得到 citation 信息（但搜索可能出现错误，那么你就需要用 Google Scholar 并且到论文网站上下载了）。

4. 管理文献条目

文献数据库的条目建立起来了，但是这只是一些 citation 和 abstract 信息，那么如何将下载下来的论文 pdf/ps 文件和它们对应的条目关联起来呢/p>

只需要将下载下来论文的文件名保存成特定的格式，一种方法是文件名中包含 BibTeXkey，如果是 A. Yao 在 2005 年发表的文章，文件名就起为 xxx-Yao2005-yyy.pdf；一种方法是文件名包含论文名。然后修改匹配规则：Options->Preferences->External Programs->Use Regular Expression Search 文本框，比如在当前目录下匹配包含 BibTeXkey 的文件：“./.*[bibtexkey].*\.[extension]”，在当前目录下匹配包含论文名的文件：“./.*[title].*\.[extension]”，在子目录中匹配包含 BibTeXkek 的文件：“**/.*[bibtexkey].*\.[extension]”。如果我们把文献数据库 bib 文件和 pdf 文件放在同一目录下，只需要使用在当前目录下匹配即可。

文件名和匹配关系修改好了，那么我们就可以将论文记录关联到文件了。如果是一次导入很多文献，可以使用批量处理：Tools->Scan database->Sychronize file links，但是同步的时候不要选择 Check existing file links，那样会很慢；处理单一记录的方法是：双击某论文条目，或者选中后按 Ctrl-e，就可以编辑该条目。进入 General 选项卡，在 File 条目后面点 Auto，JabRef 就会按照匹配规则搜索匹配的文件，关联到该条目。如果能搜索到 pdf 文件，关联后该条目的前面会出现一个 pdf 图标，点击该图标，就可以直接打开该论文的 pdf 文件。除了自动匹配以外，也可以使用 Auto 旁边的 + 号手动添加文件。

当然了，文献条目的其它信息我们也可以编辑。比如 ACM 的 BibTeX 中往往不包含摘要信息，我们可以在 Ctrl-e 以后的 Abstract 选项卡中添加对应论文的摘要信息；Springer 的 ris 信息往往过于简单，我们也可以通过网页信息添加一些条目；如果你对某篇文献有深刻印象或者想记一下笔记，可以在 Review 选项卡中记录下自己的想法。

在一个文献数据库中，文献还可以分组。View->Toggle groups interface，可以新建、修改分组，这样有一个好处是可以将该数据库所属大方向的很多小方向分组浏览，对初期准备了解研究方向大致轮廓的研究人员很有帮助。

5. 与 vim 结合使用

前面说过，JabRef 可以和很多软件结合使用，但是有一些软件我并不熟悉，所以这里仅仅介绍一下 JabRef 和 vim 关联使用的技巧。

JabRef 是使用 vim server 和 vim 通信的，所以这要求双方使用同样的 vim server 名。在 JabRef 一端，Options->Preferences->External Programs->Vim Server Name 文本框中就是 vim server 名，你可以使用默认的 vim 服务器名 vim，也可以修改成任意名字，比如 solrexvim；在 vim 一端，编辑 LaTeX 文件时不要使用通常的命令启动 vim，要加上 vim 服务器名，比如 vim –servername solrexvim –remote-silent xxx.tex，这条命令的意思是：使用 vim 连接到服务器 solrexvim 修改 xxx.tex 文件，如果该服务器不存在，就创建它。

等 JabRef 和 Vim 都启动了以后，如果在编辑 tex 文件的时候想加入某条文献的引用，只需要在 JabRef 上方的工具栏中先选择出 Vim，然后再点击该图标，vim 光标所在位置就会自动加入该文献的引用。

6. 其它应用

总的来说，JabRef 的作用主要是参考文献管理工具，但是也可以使用它来做一些其它的工作，比如个人数字图书馆。每个人电脑里可能都有一些电子书，有的人特别多。为了查阅方便，一般都会把电子书分门别类放到一个目录树中，每次找文件都要进到很深的目录下；有时候为了系统兼容性，避免使用中文文件名，理解一个文件对应哪本电子书成为一件痛苦的事。如果使用 JabRef 作为文件管理工具，就可以根据作者，书名排序或者直接检索，会方便很多。

7. 结语

本文简要介绍了 JabRef 的基本使用方法。我也是刚刚接触这个软件，对其体会并不深刻，可能 JabRef 还有很多特性可以加以发掘，就留给大家一起探索吧。

2009年6月6日添加：JabRef 在 2.5beta 版之后已经可以支持中文，中文界面是由我翻译的。

来源：sdulibh