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https://github.com/CJ-Chen/TBtools

https://github.com/ni1o1/pygeo-tutorial

https://github.com/neesjanvaneck/VOSviewer-Online

Releases · spm/spm12 · GitHub

绘科研-FigDraw 

本地绘制软件包

Networks / Pajek

cytoscape

networkx（python包，NetworkX — NetworkX documentation）

igraph – Network analysis software（python-igraph）

Gephi – The Open Graph Viz Platform

gnuplot homepage

The Boost Graph Library – 1.78.0

SNAP: Stanford Network Analysis Project

Brain Connectivity Toolbox – File Exchange – MATLAB Central

GitHub – sandywang/GRETNA: A Graph-theoretical Network Analysis Toolkit in MATLAB

https://www.nitrc.org/projects/gretna

https://www.nitrc.org/projects/bnv/

GitHub – spm/spm12: SPM12

SPM – MATLAB Central

Download the SPM Software – Statistical Parametric Mapping

SPM12 Software – Statistical Parametric Mapping

Microsoft Visio（付费）

NVisual （付费）

复杂网络公开数据集

• Pajek（可视化工具）数据集：http://vladowiki.fmf.uni-lj.si/doku.phpd=pajek:data:index；
• Newman（复杂网络科学领域大牛）个人数据集：http://www-personal.umich.edu/~mejn/netdata/
• Stanford大学大规模网络数据集：http://snap.stanford.edu/data/
• 复旦大学网络数据集整理：http://gdm.fudan.edu.cn/GDMWiki/Wiki.jspage=Network%20DataSet
• KONECT数据集整理：http://konect.uni-koblenz.de/

相关资料：

复杂网络建模与分析：常用的分析与可视化工具 – 哔哩哔哩

各种复杂网络处理工具_jaywangpku的博客-CSDN博客_复杂网络工具

https://www.csdn.net/tags/MtTaMg4sMzkwMDQ3LWJsb2cO0O0O.html

复杂网络或图论的特性该用什么软件怎么求- 知乎

SNAP复杂网络处理平台_jaywangpku的博客-CSDN博客_snap复杂网络

[Network Analysis] 复杂网络分析总结 – Poll的笔记 – 博客园

来源：teengad