甲基化检测软件——Tombo

1.Tombo是一套工具,主要用于从纳米孔测序数据中鉴定修饰的核苷酸。Tombo还提供用于分析和可视化原始纳米孔信号的工具。

2.安装。

 3.关于tombo的使用参数。

 

4.人CpG甲基化检测。

产生的文件:

  • human_cpg_testing.coverage.plus.bedgraph

  • human_cpg_testing.coverage.minus.bedgraph

  • human_cpg_testing.CpG.dampened_fraction_modified_reads.plus.wig

  • human_cpg_testing.CpG.dampened_fraction_modified_reads.minus.wig

本文主要来自: https://github.com/nanoporetech/tombo

来源:随风而逝*

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