生物信息学
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【如何使用Jellyfish进行Kmer频数统计分析?】2022年版本
软件概述 将基因组等序列文件,按长度为K的字符串进行切割、归类以及频数统计。 软件安装 软件版本:2.3.0 软件使用 可以直接查看帮助文档: 接下来以大肠杆菌为例,对Jellyf…
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【如何拆分多倍体亚基因组?】SubPhaser软件
SubPhaser原文链接:https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18173 (2)测试 上述运行的脚本, 内容如…
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【实用教程】使用AlphaFold2进行蛋白质结构在线预测
文章目录 AlphaFold2 查询AlphaFold2已经预测好的结构 AlphaFold2源代码 使用AlphaFold2在线预测 AlphaFold2参数修改 预测结果 预测…
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利用MEGA做序列比对
MEGA是Molecular Evolutionary Genetics Analysis的英文简称,MEGA是一款功能强大、操作简单,图形化界面的应用于分子进化遗传学分析的软件。…
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TBtools安装教程以及序列提取步骤
TBtools使用教程 一、 TBtools软件安装 下载地址: https://github.com/CJ-Chen/TBtools-Manual 点击安装包正常安装就可以 二、…
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如何使用MEGA软件构建系统发育树_速成实用经验
本文主要介绍了使用MEGA7软件为获取的未知基因序列构建系统发育树,并从中获取基因序列的种属信息。 工欲善其事,必先利其器。我想,介绍构建系统发育树之前有必要介绍一下建树过程中用到…
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Mothur可视化_Mothur输出结果可视化_测序数据分析常用图表
本文主要讲解了对生物信息分析软件Mothur的分析输出结果文件进行图形可视化,及其可视化结果的应用。 前言:小编刚开始看高通量测序数据分析文章的时候,感觉个个图表都高大上,但只觉得…
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【MOOC-生物信息学-蛋白质结构预测与分析】(占坑)
一、蛋白质的结构 1、 蛋白质的结构分为四级 一级结构:氨基酸序列 二级结构:周期性的结构构象 三级结构:整条多肽链的三维空间结构 四级结构;多个亚基形成的复合体结构 二、蛋白质的…
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SInC的下载及使用
最近做毕设要用到SInC这个工具,往基因序列里插入拷贝数变异,然鹅,我对它一窍不通,网上资料也比较少,特此写篇博文来记录一下自己的心路历程 下载 SInC是在下面这篇论文中提出的,…
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图解三代测序(Nanopore)
一、测序原理 先介绍 Nanopore 测序中的几位主角: :在自然界中,有一种可以嵌入到细胞膜中作为离子或分子通道的跨膜蛋白,具有天然的蛋白纳米孔。经过人为基因工程修饰后,得到的…