01.最常见的EXCEL
这个不用多说，小伙伴们都比较熟悉，不少小伙伴也习惯用excel来整理数据。不过需要注意的是，excel虽然在处理图表时功能强大，在作数据图方面，也毫不逊色，但是，它生成的图，分辨率有限。一般小文章要求不高（300dpi）没问题，但是一些要求严格的期刊，如1200dpi，它就无能为力了。而且，图片的导出只能通过复制、截图或者用VBA，前两者分辨率可能不满足要求，后者要装VBA，操作也非常麻烦。此外，有些特殊的图，excel也显得有心无力，比如纵坐标分段，又比如，临床研究中的生存曲线。
02.Origin和Origin Pro
这两个都是Origin Lab 公司研发的专业制图和数据分析软件，简单易学、功能齐全、操作也很灵活，大部分科学研究的统计、作图、函数拟合等要求都可以满足，尤其适合曲线、曲面的图。它还提供了几十种二维和三维绘图模板，而且允许用户自己定制模板。Origin pro是Origin的专业版，增加了峰值拟合、表明拟合、统计、信号处理等功能。生成的图片可以很方便地导出为TIFF/BMP/EPS等十多种格式。
03.适合医学的Prism
一个简单易用的医学绘图软件，功能非常强大，几乎能搞定所有医学研究所需的统计与作图。
除了作图之外，它还能帮你把不同的图组合之后导出，但是形式比较单一（见下图排列的方式）。
04.Statistical Product and Service Solutions（SPSS）
SPSS是世界上最早的统计分析软件，它的主打功能是数据统计分析（据说在国际学术界有条不成文的规定，即在国际学术交流中，凡是用SPSS软件完成的计算和统计分析，可以不必说明算法，由此可见其影响之大和信誉之高），但是它的作图功能也算齐全，而且很多excel无法做的统计型结果图（如误差线图），在它这里就很简单。
05.MATLAB
这个绝对是灰机中的战斗机。其强大的数据处理能力加上出色的显示能力，几乎能做所有的图片处理，传说只有你想不到，没有它做不到！但是使用它首先得学会MATLAB的编程。
二、关于图片的导出
上面提到的软件，除了excel外，本身都有强大的图片导出功能。而事实上，我们除了数据统计作图后需要导出图外，还有一些图片，是实验过程中拍摄的照片，如荧光显微镜拍的显微照片。
一般这些仪器配套的拍摄软件都会有比较齐全的图片导出功能。但是有些小伙伴觉得截图更方便，又不想损失分辨率。这里给大家推荐两款截图软件：ACDsee、Snagit。这两款操作简便，功能也非常强大，Snagit甚至可以捕获活动的画面。
三、共聚焦图片的处理
01拍照时要保留大中小三个倍数的图，且图片分辨率不能太低（我们用1024*1024），能大则大，我们是因为机器限制。用的时候要进行裁减，比如文章上放的是200倍和400倍的图，实际上200倍的图来自拍照时100倍的图，400倍的图来自拍照时200倍的图。这样有利于准确地形成系列图片。
02图片对比度、中间色之类可以（或者是必须）在保证趋势的基础上进行适当调整。
03荧光图片不提倡定量，定量要配合western。
04应该是tif格式。
05拍照时一般不要把对比度调节的太大，尽量保存细节。拍的太强了后期是不好调弱的，或者背底太暗了也会丢失细节的。这些后期都可以通过软件调节。
06低倍-高倍的顺序。反之会形成暗区，特别是在高倍加zoom放大层扫之后特别明显。这是教训，不能看见高倍下面比较好的结果，就欣喜若狂，先高倍后低倍。
07一定要保留你的oib格式，不能因为省空间，只存留tif格式。有些杂志会要求伪色，比如，红色的用粉色显示，要是有oib格式就很好调整，重新出图就是。没有oib，用tif也可以用其他软件转换，但总觉得最后的颜色不是很对，因为很难把握粉色的色值。
08层扫的图片叠加或出2D的tif图，建议不要用“输出所见”这个选项，这样出来的1024-1024的会变成512-512，这时候还是选择一般tif，1024-1024，后期再用其他软件合成会比较好。
09结果好，拍照好，才是最基本的，一定要杜绝对结果的修改。对于形态学的图片来说，用软件修改后的用一些二进制的软件打开后可以明显看出修改过程。
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来源：艾德思EditSprings
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